MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Lactococcus lactis subsp. cremoris NZ9000 chromosome

Total Repeats: 46562

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S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_017949	T	7	7	84	90	0 %	100 %	0 %	0 %	389853199
2	NC_017949	TGTC	2	8	110	117	0 %	50 %	25 %	25 %	389853199
3	NC_017949	CTTG	2	8	138	145	0 %	50 %	25 %	25 %	389853199
4	NC_017949	A	6	6	157	162	100 %	0 %	0 %	0 %	389853199
5	NC_017949	ATT	2	6	164	169	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853199
6	NC_017949	A	6	6	172	177	100 %	0 %	0 %	0 %	389853199
7	NC_017949	GAT	2	6	222	227	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853199
8	NC_017949	ATG	2	6	248	253	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853199
9	NC_017949	CGT	2	6	274	279	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389853199
10	NC_017949	AATC	2	8	286	293	50 %	25 %	0 %	25 %	389853199
11	NC_017949	TGA	2	6	300	305	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853199
12	NC_017949	GCA	2	6	412	417	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389853199
13	NC_017949	TTGCTG	2	12	419	430	0 %	50 %	33.33 %	16.67 %	389853199
14	NC_017949	TGG	2	6	468	473	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389853199
15	NC_017949	ATGC	2	8	499	506	25 %	25 %	25 %	25 %	389853199
16	NC_017949	ACTT	2	8	644	651	25 %	50 %	0 %	25 %	389853199
17	NC_017949	GAT	2	6	658	663	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853199
18	NC_017949	AAG	2	6	683	688	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853199
19	NC_017949	ACT	2	6	826	831	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389853199
20	NC_017949	CTA	2	6	871	876	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389853199
21	NC_017949	A	6	6	1056	1061	100 %	0 %	0 %	0 %	389853199
22	NC_017949	CAA	2	6	1069	1074	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389853199
23	NC_017949	A	8	8	1095	1102	100 %	0 %	0 %	0 %	389853199
24	NC_017949	ATT	2	6	1121	1126	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853199
25	NC_017949	TGG	2	6	1254	1259	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	389853199
26	NC_017949	ACA	2	6	1270	1275	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389853199
27	NC_017949	TAA	2	6	1539	1544	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389853200
28	NC_017949	TTGAAG	2	12	1628	1639	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853200
29	NC_017949	TCAA	2	8	1678	1685	50 %	25 %	0 %	25 %	389853200
30	NC_017949	ATA	2	6	1703	1708	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389853200
31	NC_017949	TTA	2	6	1747	1752	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853200
32	NC_017949	GCT	2	6	1756	1761	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389853200
33	NC_017949	GTA	2	6	1774	1779	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853200
34	NC_017949	TTG	2	6	1834	1839	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853200
35	NC_017949	TTC	2	6	1917	1922	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389853200
36	NC_017949	TGAAAG	2	12	1931	1942	50 %	16.67 %	33.33 %	0 %	389853200
37	NC_017949	GAAA	2	8	1947	1954	75 %	0 %	25 %	0 %	389853200
38	NC_017949	AGA	2	6	2097	2102	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853200
39	NC_017949	ATCA	2	8	2139	2146	50 %	25 %	0 %	25 %	389853200
40	NC_017949	ATG	2	6	2171	2176	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853200
41	NC_017949	AAG	2	6	2177	2182	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853200
42	NC_017949	TCA	2	6	2195	2200	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389853200
43	NC_017949	TTA	2	6	2238	2243	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853200
44	NC_017949	TTGA	2	8	2251	2258	25 %	50 %	25 %	0 %	389853200
45	NC_017949	TGC	2	6	2328	2333	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	389853200
46	NC_017949	CAAC	2	8	2381	2388	50 %	0 %	0 %	50 %	389853200
47	NC_017949	GAA	2	6	2464	2469	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853200
48	NC_017949	AAG	2	6	2486	2491	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853200
49	NC_017949	TATC	2	8	2501	2508	25 %	50 %	0 %	25 %	389853200
50	NC_017949	TGAT	2	8	2528	2535	25 %	50 %	25 %	0 %	389853200
51	NC_017949	GAA	2	6	2617	2622	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853200
52	NC_017949	GTAC	2	8	2650	2657	25 %	25 %	25 %	25 %	389853200
53	NC_017949	AATT	2	8	2659	2666	50 %	50 %	0 %	0 %	389853200
54	NC_017949	TA	3	6	2780	2785	50 %	50 %	0 %	0 %	389853201
55	NC_017949	ATT	2	6	2814	2819	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853201
56	NC_017949	GAA	2	6	2833	2838	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853201
57	NC_017949	A	7	7	2843	2849	100 %	0 %	0 %	0 %	389853201
58	NC_017949	TAC	2	6	2860	2865	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389853201
59	NC_017949	CTT	2	6	2873	2878	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389853201
60	NC_017949	GAAA	2	8	2898	2905	75 %	0 %	25 %	0 %	389853201
61	NC_017949	CAG	2	6	2936	2941	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389853201
62	NC_017949	AAC	2	6	2969	2974	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389853201
63	NC_017949	TTA	2	6	2979	2984	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853201
64	NC_017949	CAA	2	6	3005	3010	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	389853201
65	NC_017949	A	6	6	3073	3078	100 %	0 %	0 %	0 %	389853201
66	NC_017949	A	7	7	3214	3220	100 %	0 %	0 %	0 %	389853201
67	NC_017949	TTG	2	6	3296	3301	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853201
68	NC_017949	CAG	2	6	3316	3321	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389853201
69	NC_017949	GAA	2	6	3370	3375	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853201
70	NC_017949	TTAT	2	8	3379	3386	25 %	75 %	0 %	0 %	389853201
71	NC_017949	TGT	2	6	3417	3422	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853201
72	NC_017949	TGA	2	6	3435	3440	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853201
73	NC_017949	GAT	2	6	3489	3494	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853201
74	NC_017949	AAAT	2	8	3507	3514	75 %	25 %	0 %	0 %	389853201
75	NC_017949	CTT	2	6	3539	3544	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	389853201
76	NC_017949	TTA	2	6	3605	3610	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	389853201
77	NC_017949	TGA	2	6	3612	3617	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853201
78	NC_017949	A	6	6	3617	3622	100 %	0 %	0 %	0 %	389853201
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80	NC_017949	A	6	6	3716	3721	100 %	0 %	0 %	0 %	389853201
81	NC_017949	T	6	6	3735	3740	0 %	100 %	0 %	0 %	389853201
82	NC_017949	CAG	2	6	3770	3775	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389853201
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85	NC_017949	T	8	8	3869	3876	0 %	100 %	0 %	0 %	389853201
86	NC_017949	A	8	8	3895	3902	100 %	0 %	0 %	0 %	389853201
87	NC_017949	GAT	2	6	3916	3921	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853201
88	NC_017949	AAAGT	2	10	3938	3947	60 %	20 %	20 %	0 %	389853201
89	NC_017949	TGA	2	6	3966	3971	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853201
90	NC_017949	AGA	2	6	4038	4043	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853201
91	NC_017949	ACT	2	6	4098	4103	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	389853201
92	NC_017949	AAT	2	6	4138	4143	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389853201
93	NC_017949	A	8	8	4146	4153	100 %	0 %	0 %	0 %	389853201
94	NC_017949	A	7	7	4158	4164	100 %	0 %	0 %	0 %	389853201
95	NC_017949	T	6	6	4325	4330	0 %	100 %	0 %	0 %	389853201
96	NC_017949	TGA	2	6	4332	4337	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853201
97	NC_017949	ATGTTG	2	12	4415	4426	16.67 %	50 %	33.33 %	0 %	389853201
98	NC_017949	TTG	2	6	4448	4453	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853201
99	NC_017949	TGA	2	6	4572	4577	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853201
100	NC_017949	A	7	7	4616	4622	100 %	0 %	0 %	0 %	389853201
101	NC_017949	AG	3	6	4659	4664	50 %	0 %	50 %	0 %	389853201
102	NC_017949	TGA	2	6	4746	4751	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853201
103	NC_017949	A	6	6	4751	4756	100 %	0 %	0 %	0 %	389853201
104	NC_017949	A	6	6	4763	4768	100 %	0 %	0 %	0 %	389853201
105	NC_017949	T	6	6	4892	4897	0 %	100 %	0 %	0 %	389853201
106	NC_017949	A	6	6	4943	4948	100 %	0 %	0 %	0 %	389853201
107	NC_017949	AC	3	6	4997	5002	50 %	0 %	0 %	50 %	389853201
108	NC_017949	TTG	2	6	5138	5143	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853201
109	NC_017949	T	6	6	5148	5153	0 %	100 %	0 %	0 %	389853201
110	NC_017949	GACT	2	8	5184	5191	25 %	25 %	25 %	25 %	389853201
111	NC_017949	CAG	2	6	5195	5200	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389853201
112	NC_017949	TGA	2	6	5208	5213	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853201
113	NC_017949	AAG	2	6	5234	5239	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853201
114	NC_017949	AGA	2	6	5304	5309	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853201
115	NC_017949	TGA	2	6	5355	5360	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853201
116	NC_017949	AGT	2	6	5383	5388	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853201
117	NC_017949	TGA	2	6	5427	5432	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853201
118	NC_017949	TATT	2	8	5433	5440	25 %	75 %	0 %	0 %	389853201
119	NC_017949	GAA	2	6	5447	5452	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853201
120	NC_017949	TCAT	2	8	5514	5521	25 %	50 %	0 %	25 %	389853201
121	NC_017949	ATG	2	6	5540	5545	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	389853201
122	NC_017949	A	6	6	5603	5608	100 %	0 %	0 %	0 %	389853201
123	NC_017949	TTTA	2	8	5621	5628	25 %	75 %	0 %	0 %	389853201
124	NC_017949	AACC	2	8	5638	5645	50 %	0 %	0 %	50 %	389853201
125	NC_017949	AGA	2	6	5727	5732	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853201
126	NC_017949	GCA	2	6	5734	5739	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	389853201
127	NC_017949	A	6	6	5772	5777	100 %	0 %	0 %	0 %	389853201
128	NC_017949	GAA	3	9	5794	5802	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	389853201
129	NC_017949	A	6	6	5860	5865	100 %	0 %	0 %	0 %	389853201
130	NC_017949	CAAT	2	8	5876	5883	50 %	25 %	0 %	25 %	389853201
131	NC_017949	AAT	2	6	5886	5891	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	389853201
132	NC_017949	ATGA	2	8	5986	5993	50 %	25 %	25 %	0 %	389853201
133	NC_017949	AT	3	6	6120	6125	50 %	50 %	0 %	0 %	389853202
134	NC_017949	TTG	2	6	6177	6182	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	389853202
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